根据《互联网药品信息服务管理办法》规定，任何单位和个人未取得相关准入许可前不得通过互联网向上网用户提供药品（含医疗器械）信息。因此，如果想要通过互联网向用户提供药品信息，必须办理《互联网药品信息服务资格证书》。

然而，在实践中，有些企业在备案过程中遇到了备案部门要求提供《互联网药品信息服务资格证书》的情况。这主要是因为备案部门在审核企业资料时，可能会将企业名称或经营范围中包含药品、医疗器械、生物科技等词汇的企业视为涉及药品信息服务的对象。但是，这种做法是不准确的。企业的经营内容与其网站内容并没有必然的联系。

因此，对于企业来说，如果遇到了这种情况，应该向备案部门进行解释和说明。同时，也可以积极开展宣传和普及工作，让更多的人了解相关政策和法规。此外，企业还可以通过加强内部管理和规范网站内容等方式来避免出现类似的问题。

企业在办理网站备案时应该注意相关政策和法规的变化，同时加强自身管理和规范网站内容，以避免出现不必要的误解和问题。