危险品出口海运到南苏丹报关可能会面临以下几个难题：

1.政治不稳定：南苏丹局势不稳，常常发生冲突和战争，因此出口海运过程中可能面临安全和运输风险。

2.海关规定和要求：南苏丹海关的规定和要求可能与其他国家不同，需要根据当地法规和安全标准进行出口前的前期准备工作，并严格遵守海关程序。

3.缺乏基础设施：南苏丹的基础设施相对较差，货物运输可能会受到道路、水路、机场等环境因素的限制。

4.文化差异：由于南苏丹和其他国家的文化差异较大，可能需要认真了解当地生活和风俗习惯。