马来西亚公司审计是当马来西亚公司做账报税后，该马来西亚公司是义务要整理和完成每年的账目资料并准备审计报告给马来西亚公司委员会以及安排把每年的公司所得税申报给马来西亚内陆税收局。

马来西亚公司与马来西亚有限公司的流程是不同的。马来西亚公司也称马来西亚个体户和马来西亚合作企业，该流程是有如以下：
评估、报价、商洽后签订做账报税委托书—>缴付全款->客户提交资料—>账务处理—>报表结果—>客户签名同意报表结果—>报表提交给财税师做草表报税—>客户签名同意报税结果—>财税师提交报税结果—>打印税务收条—>账务资料寄回客户—>客户文件确认书—>文件存档

而马来西亚有限公司的流程是有如以下：
评估、报价、商洽后签订做账报税委托书—>缴付全款—>客户提交资料—>账务处理—>报表结果—>审计安排—>回答审计和税务师问题—>确认草表审计和税务结果—>出正式审计和税务报告—>客户签名同意报告和拿报税支票—>报告送审计师提交和税务师报税—>两份审计报告和账务资料返回—>打印税务收条—>账务资料寄回客户—>客户文件确认书—>文件存档

马来西亚做账、审计和报税都有固定的提交时间。个人所得税是要在每年四月三十号前，马来西亚个体户与马来西亚合伙企业做账报税：每一年六月三十号前。

马来西亚有限公司做账报税是要在十八个月内要完成做账、审计和报税（新成立公司年）；而注册第二年或以上的公司要根据公司所制定的会计年度的六个月内要完成做账、审计和报税。

马来西亚税收种类分为直接税和间接税。直接税是包括所得税、不动产利得税和石油所得税等；而间接税则是包括国产税、关税和进出口税、销售税、服务税和印花税等。