办理北京各区的医疗器械二类备案凭证代办，可以参考以下步骤：

确定产品类别：根据医疗器械分类目录，确定需要备案的产品类别。

准备材料：根据相关规定，准备需要提交的材料，包括产品注册申请表、产品检测报告、产品说明书、生产厂家资质证明等。

提交申请：将准备好的材料提交给所在区县的食品药品监督管理部门。

审核材料：管理部门会对提交的材料进行审核，如果材料齐全、符合要求，会进行现场勘查。

领取备案凭证：如果现场勘查合格，管理部门会颁发医疗器械二类备案凭证，可以前往领取。

需要注意的是，不同地区的具体办理流程和要求可能会有所不同，建议在办理前先咨询当地食品药品监督管理部门的详细要求和相关规定。同时，为了确保顺利通过审核，建议提前准备好相关材料并严格遵守相关规定。