在厦门要申请软件著作权，有两种方式。第一自己通过国家版权中心平台注册申请，第二种请代理进行申请。具体的流程如下：

1、填写软著登记办理申请表；

2、提交软著登记办理申请文件；

3、登记机构受理登记申请；

4、审查；

5、取得登记证书。

在申请之前要具体看申请的时间来收取费用，有分加急和不加急办理。