无人机经营许可证申请的通用航空企业办理周期为45-60个工作日，在审批后还需与通航协会进行备案。

具体来说，不同地区的办理周期如下：

华北地区（北京、天津、山西、内蒙古、河北）：45-60个工作日内

东北地区（黑龙江、吉林、辽宁）：30-45个工作日内

中南地区（湖南、湖北、河南、广西、广东、海南）：30-45个工作日内

华东地区（上海、浙江、江苏、山东、江西、福建、安徽）：30-45个工作日内

西南地区（四川、重庆、云南、贵州、西藏）：45-60个工作日内

西北地区（陕西、宁夏、甘肃、青海）：30-45个工作日内

新疆地区（新疆）：30-45个工作日内

具体办理时间可能因实际情况而有所不同，建议咨询相关机构获取具体信息。