医用核磁共振设备在泰国的医疗器械认证过程中的费用会因多个因素而异，包括设备类型、注册类型、文件审核的复杂性以及与认证机构或代理商的合作等。因此，确切的费用将因情况而异。以下是可能影响费用的一些因素：

注册类型： 泰国的医疗器械注册分为不同的等级（Class 3 和 Class 4 等），不同的等级可能需要支付不同的费用。

文件审核： FDA对提交的文件进行审核，审核过程中可能需要支付一定的费用，审核费用可能因审核的复杂性而有所不同。

实地审核： 如果FDA要求进行生产工厂的实地审核，这可能导致额外的费用，包括审核人员的差旅费用和住宿费用。

测试和验证： 进行性能测试、电磁兼容性测试、辐射安全测试等可能需要支付测试费用。

专业咨询： 许多公司选择与专业的医疗器械咨询公司合作，以确保顺利完成认证流程。这些咨询公司通常会收取咨询费用。

年度维护费用： 一旦设备获得认证，可能需要支付年度维护费用，以确保设备持续合规。

具体的费用将根据您的具体情况和所需的服务而有所不同。在开始注册过程之前，建议与泰国的FDA或专业的医疗器械咨询公司联系，以获取关于费用和费用结构的详细信息。这将有助于您做好预算并了解整个认证流程的成本。请注意，医疗器械认证的费用通常是一个必要的投资，以确保设备在泰国市场上合法上市和使用。