北京密云县排水沟淤泥清理、暖气沟清掏、污水抽运菌种运输设备可以找专业的清洁公司或者有相关设备的工程队伍。在进行这些服务时，需要确保操作符合当地法律法规，并采取适当的安全措施，以确保人员和环境的安全。

在沟渠清理过程中，一般会使用挖掘机、吸污车、抽粪车等设备。首先，将沟渠中的淤泥和杂物清理出来，然后用挖掘机将杂物装袋，运至指定处理地点。对于较深的暖气沟，可能需要使用专业工具或人员，以及适当的防护设备。污水抽运则涉及到使用抽粪车或相关设备，将沟渠中的污水抽运出去。运输菌种的过程则需要根据具体的菌种类型和数量，采取适当的包装和运输措施。

在选择服务提供商时，请确保选择有相关资质和经验的团队，并了解他们的服务价格和合同条款。此外，还可以咨询当地的huanbaobumen或物业管理公司，了解有关当地排水沟清理和污水处理的法规和标准。