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血红蛋白是由一种称为珠朊的蛋白和含铁的亚铁血红素结合在一起组成的，亚铁血红素是卟啉的铁（Ⅱ）络合物，在其中铁（Ⅱ）原子的配位数为6。铁（Ⅱ）与卟啉平面上的四个吡咯环氮原子相联结，并与珠朊上组氨酸的咪唑氮在垂直于卟啉平面的方向上联结，第六个位置则可能被一个水分子所占据。这个结构允许在此第六个配位位置上可逆地吸放分子氧，使红血球得以把氧分子输载到身体的各部分，这是动物呼吸作用的机理。血红蛋白对一氧化碳的亲合作用大于对氧分子的亲合作用，生成碳氧血红蛋白的过程是不可逆的，这就导致了一氧化碳的剧毒性。

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