研究院主要目的是研究相关项目的课题，不考核盈利。当然不同出资性质的研究院也有所不同。如果按照教育性质、 企业性质和政府性质三种出资机构划分研究院，那么他们的的任务侧重点则有所不同。简单来说，教育和政府性质的主要以研究为目的，而企业性质的研究院，是为了给企业提供科学技术支持，更加注重时效性和实用性，推动科学技术和经济合作，名利双收。

公司是企业，是以利为目的的。无论是国家企业，地方国资企业、私人合资企业等，他们的目的都是盈利。

然后，因为研究院早已停办，所以在会有一定的经营宣传和用户认知基础，而普通公司注册和经营年限这不受限。

从发展前途上，研究院在竞标时可以标注更大的标的，成功几率更大一些。研究院可以研制开发一些自行的产品，而企业是通过生产或提供产品或者服务实现盈利。