办理软组织超声手术仪的三类进口医疗器械许可证通常需要遵循国家或地区的医疗器械监管机构的法规和程序。以下是一般性的步骤，但请注意，具体的办理流程会因国家或地区而异：

确定适用法规和许可证类别：首先，确定您的软组织超声手术仪属于哪种许可证类别（通常为三类医疗器械），并了解适用的法规和标准。

技术文件准备：准备必要的技术文件，包括产品规格、性能验证数据、临床试验结果、生产工艺信息、质量管理体系文件等。

质量管理体系认证：根据需要，确保您的公司符合质量管理体系标准，如ISO 13485，并获得相关认证。

申请填写：填写医疗器械许可证申请表格，并提交必要的文件和信息。

提交申请：向当地的医疗器械监管机构递交许可证申请，通常需要支付相关的申请费用。

技术文件审核：监管机构可能会审核您的技术文件，以确保其符合法规要求。

审查和评估：监管机构将对您的申请进行审查和评估，包括文件审核、可能的现场检查和质量管理审核。

审批和发证：如果您的申请获得批准，监管机构将颁发医疗器械许可证，允许您在市场上销售和分发产品。

持续合规：一旦获得许可证，您需要持续遵守法规和标准，包括更新技术文件、维护质量管理体系、报告不良事件等。

请注意，具体的流程和要求会因国家或地区的监管机构而异。因此，建议与当地的医疗器械监管机构联系，获取详细的指导和要求。在处理医疗器械许可证申请时，与顾问或代办公司合作，以确保申请过程顺利，并满足适用的法规和标准。