代办三类进口医疗器械射频治疗仪的费用会因多个因素而有所不同，包括产品的性质和复杂性、国家或地区的法规要求、代办注册公司的收费政策以及其他相关因素。因此，具体的代办费用可能会有很大的变化。

以下是一些可能影响代办费用的因素：

产品性质和复杂性：产品的性质和复杂性会直接影响代办费用。更复杂的产品通常需要更多的时间和资源来完成代办。

国家或地区要求：不同国家或地区的医疗器械注册和代办要求各不相同，可能会导致不同的费用结构。

代办注册公司：不同的代办注册公司可能具有不同的定价结构。一些公司可能提供更全面的服务，而其他公司可能提供更基本的服务。

技术文件和合规性：准备技术文件、质量管理体系文件以及确保产品的合规性可能需要额外的费用。

审核和检查：如果监管机构要求对生产设施进行审核和检查，相关费用可能会增加。

法规合规性咨询：您可能需要聘请法规专家或律师来确保您的申请和文件符合法规，这也会增加费用。

市场需求：如果市场竞争激烈，代办价格可能会有所不同。高需求领域可能需要更多的资源来完成代办。

代办费用可以在几千到数万元之间变动，具体取决于上述因素的组合。建议您与多家代办注册公司联系，向他们咨询代办费用和费用结构，以便选择最适合您的需求和预算的代办公司。同时，确保与代办公司讨论清楚他们提供的服务范围，以确保您的代办过程是符合法规的