一、名称不同

个体户只能叫店、超市、商行、经营部等、不能有公司字样。
二、投资主体不同
个体户投资主体只能是自然人或家庭；公司可以是自然人，也可以是企业。
三、变更转让不同
个体户不能变更法人，既不能转让，不经营只能注销；公司可以变更法人、股东，不经营可转让。
四、能否开分支机构
个体户不能开分支机构，公司可以。
五、承担责任不同
个体户倒闭时以个人或家庭财产承担无限清偿责任；
有限责任公司倒闭时向法院申请破产保护，以公司资产及股东出资额为限对公司债务承担有限责任，如注册资本金为50万，而公司欠债200，只需还50万即可，不追究股东个人财产。
六、税收不同
个体户除增值税外，只有个人生产经营所得税，公司除增值税外，还有企业所得税和个人所得税，税收监管相对严格。