在日本，医疗器械的注册由日本厚生劳动省的医药品医疗器械管理局（PMDA）负责。要在日本注册冠状动脉功能测量系统产品，通常需要遵循以下步骤：
1. 确定注册路径：根据产品类型和特征，确定适用的注册路径（例如，特定器械注册、一般医疗器械注册）。
2. 准备文件和资料：注册申请文件： 获取PMDA提供的医疗器械注册申请表格，并填写完整。
产品技术文件： 提供详细的产品技术文件，包括产品说明、功能描述、规格、制造工艺、质量控制等信息。
临床试验数据： 如果适用，提供与产品安全性和有效性相关的临床试验数据。
质量管理文件： 提供质量管理体系文件，如ISO 13485认证等。
3. 指定日本负责人：大多数情况下，需要指定日本境内的负责人或代理人来代表企业并协助完成注册程序。
4. 提交注册申请：将准备好的文件和资料提交给PMDA，完成医疗器械注册申请。
5. 审核和批准：PMDA将对申请进行审核和评估。可能需要额外的信息或文件来确保申请的完整性和合规性。
通过审核后，PMDA会颁发医疗器械注册批准，允许产品在日本市场上销售和使用。
6. 后续监管：注册成功后，需要遵守PMDA的监管规定和要求，包括质量控制、产品标签、定期报告等。
在提交注册申请之前，建议详细了解PMDA的注册要求和流程，确保准备的文件和资料完整、准确，并符合日本的法规和标准。与当地的负责人或咨询机构合作可能有助于更顺利地完成注册流程。