检测技术服务:iTRAQ/TMT标签结构及相对定量原理详解--检测技术服务详情

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iTRAQ和TMT标签简介

说到iTRAQ（Isobaric Tag for Relative and Absolute Quantitation）和TMT（Tandem Mass Tag），很多人可能会认为它们是两种不同的定量蛋白质组学技术，但实际上，除了标记规格和标记分子结构以及开发者的差异外，它们标记肽的原理基本相同。iTRAQ首先由AB SCIEX开发，随后TMT由Thermo Fisher开发。尽管它们拥有不同的专利，但它们使用几乎相同的原理。

iTRAQ和TMT标记物本质上是一种化学体外标记试剂，专门标记蛋白质消化产生的肽。iTRAQ和TMT标记的蛋白质样品有不同的尺寸。相比之下，TMT可以标记更广泛的样品，并同时定量多组蛋白质样品，至少2个zuì多10个。通过标记多组不同样本，TMT和iTRAQ可以同时比较正常组织样本和肿瘤组织样本中的蛋白质水平，并准确检测肿瘤发展不同阶段蛋白质水平的变化。

虽然iTRAQ和TMT的标签原理相同，但它们的标签结构存在差异。

iTRAQ分子结构与TMT分子结构的比较

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从上图可以看出，iTRAQ和TMT标签在结构上存在明显差异，但确实有一些共同点。首先，两个标签均由报告基团、平衡基团和肽反应基团组成。它们各自的报告基团和平衡基团的总重量是恒定的。此外，两个标签的肽反应基团结构也相同。iTRAQ和TMT标签的区别在于平衡基团的结构。从图中可以看出，TMT的平衡基团结构比iTRAQ标签的更复杂。iTRAQ的平衡基团只有几十Da，而TMT的平衡基团接近200Da，这也是它们质量不同的原因。

在简要介绍完两种标签的结构之后，我们以iTRAQ 4-plex标签为例，进一步了解iTRAQ分子标签的结构。

iTRAQ分子结构

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iTRAQ标签分子骨架由三个核心部分组成，一个报告基团，一个平衡基团和一个肽反应基团。不同 iTRAQ 标签的报告基团的质量是不同的。4-plex标签的报告基团质量分别为114 Da、115 Da、116 Da和117 Da。4-plex标签的平衡基团质量分别为31 Da、30 Da、29 Da和28 Da，这使4个iTRAQ标签的等重标签的总质量均等于145 Da。另一个核心组成是肽应基团，其主要作用是与多肽的游离n端氨基发生置换反应，使同位素标签与多肽的N端共价交联。

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