疗器械的代办注册费用通常会因代办公司的规模、经验、服务内容、产品类型和注册流程的复杂性而有所不同。对于二类医疗器械便携式超短波治疗仪产品的代办注册价格，以下是一些可能影响费用的因素：

产品类型和技术复杂性：产品的技术性能和特殊性会影响代办费用。一些技术复杂或需要额外临床试验的产品可能需要更多的技术支持，因此代办费用可能会相对较高。

注册流程的复杂性：注册过程中涉及的审批步骤、所需文件的多少和复杂性会直接影响代办费用。更复杂的注册流程可能意味着更高的代办费用。

服务内容：不同代办公司可能提供的服务内容略有差异，有些可能包含更多的技术支持和咨询服务，因此可能会对费用有所影响。

临床试验和技术评估：如果产品需要进行临床试验或额外的技术评估，这可能会增加代办费用。

一般来说，医疗器械的代办注册费用可能在数万元到数十万元人民币不等。具体费用需根据代办公司提供的服务内容和费用标准来确定。建议与多家代办公司联系，了解他们的服务内容和费用，并根据产品的具体情况和预算做出选择。同时，确保与代办公司签订明确的合同，明确代办的服务内容和费用，以避免后期出现纠纷。