医疗器械注册的代办费用可能会因代办公司的规模、经验、服务内容、产品类型和注册流程的复杂性而有所不同。针对二类医疗器械便携式超短波治疗仪产品的代办注册价格，以下是一些可能影响费用的因素：

代办公司的水平：有丰富经验的代办公司通常收费可能较高，因为他们提供的服务可能更加全面和。

注册流程的复杂性：产品注册涉及的审批步骤、所需文件的多少和复杂性，会直接影响代办费用。

服务内容：不同的代办公司可能提供的服务内容略有差异，例如有些可能包含更多的技术支持和咨询服务，而有些可能仅提供基本的代办服务。

产品特性和临床试验情况：如果产品具有特殊的技术特性或需要进行临床试验，可能会导致代办费用增加。

一般来说，二类医疗器械注册的代办费用可能在数万元到数十万元人民币不等。在选择代办公司时，建议向多家公司咨询，了解他们的收费标准、服务内容及额外费用，并结合产品的具体情况和预算做出选择。同时，确保与代办公司签订明确的合同，明确代办的服务内容和费用，以避免后期出现纠纷。