免洗手凝胶的主要作用就是洗手消毒，其中含有乙醇、异丙醇等杀菌成分，对细菌有明显的杀灭作用，对病毒也有一定的抑制作用，一般多用于医护工作者的外科洗手消毒、卫生手消毒以及一般皮肤消毒，很多家庭也会购买免洗手凝胶，方便外出时随时清洁。

除了消毒外，免洗手凝胶还有一定的清洁作用，可清洁双手，去除双手异味，不过需要注意的是，免洗洗手液的清洁去污效果是不如普通洗手液的，它的主要作用还是消毒。