第1阶段，企业需建立和实施环境管理体系，从形式上符合ISO14001标准的要求。主要步骤有：
一、初始环境评审
二、任命环境管理者代表
三、制订环境方针、目标
四、拟定环境管理方案
五、识别环境因素，评价出重要环境因素
六、编制环境管理体系文件
七、体系试运行
八、内审、管理评审
 

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具体来说有以下内容：
一、做好初始环境评审，做好人、财、物的准备。蕞高管理者应授权建立相应的机构，并给予人力和财物方面的支持，书面任命环境管理者代表，以满足体系建立和运行的需要。对企业过去和现在的环境管理情况进行评价，总结经验，找出存在的主要环境问题并分析其风险，以确定控制方法和将来的改进方向。
二、完成环境管理体系策划工作。所谓的环境管理体系策划，就是根据初始环境评审的结果和企业的经济技术实力，制定环境方针；确定环境管理体系构架；确定组织机构与职责；制定目标、指标、环境管理方案；确定哪些环境活动需要制定运行控制程序。
三、编制体系文件。ISO14001环境管理体系是一个文件化的环境管理体系，需编制环境管理手册、程序文件、作业指导书等。
四、运行环境管理体系。环境管理体系文件编制完成，发布实施后标志着环境管理体系已经建立并投入运行。
五、组织内审和管评。为审查企业的环境管理活动是否已按环境管理体系文件的规定进行，环境管理体系是否得到了正确的实施和保持，为确定体系的持续适用性、充分性、有效性，企业应组织内部审核和管理评审。
六、生产型企业还需要完成环评、竣工验收相关手续。

第二阶段，企业申请认证和取证。
一、企业如果确认其环境管理体系基本符合ISO14001标准要求，可向已获得认可委认可的认证机构提出认证申请并签定认证合同，进入环境管理体系认证审核阶段。企业可与认证机构协商确定审核目的、审核时间、审核组长、审核范围等内容，确认审核计划。
二、认证机构对企业的环境管理体系与ISO14001环境管理体系标准的符合性和运行、保持的有效性进行审核验证，并确定是否向企业发放认证证书。企业应按合同要求交纳审核费，积极配合审核组工作，按审核组要求做好文件资料和人员的准备，完成现场评审。
 
企业申请ISO14001体系认证，获得环境管理体系认证证书，有哪些好处呢？
一、提高了企业的管理水平；
二、树立了企业的良好形象，增强了在国内外市场中的竞争力；
三、提高了企业员工的素质、责任心和环境意识；
四、有利于企业遵守国家法律法规及其他要求；
五、有利于污染防治、节能降耗和降低生产成本；
六、有利于企业的良性发展；
七、有利于企业打破绿色贸易壁垒，进入国际市场。