音视频系统集成企业资质证书是企业在音视频系统集成领域开展业务所必须具备的重要资质之一。那么，哪些部门负责办理音视频系统集成企业资质证书呢？

首先，企业需要了解所在行业的相关政策及法规，国家工业和信息化部是音视频系统集成行业的主管部门，负责制定音视频系统集成的相关政策和法规，企业需要遵守相关规定并按照要求申请办理资质证书。

其次，企业需要前往当地工业和信息化部门申请办理音视频系统集成企业资质证书。不同地区的具体办理部门可能有所不同，企业可以在当地工业和信息化部门网站上查询具体办理流程和要求。

此外，一些行业协会和组织也会认证音视频系统集成企业资质，企业可以根据自身需要选择是否申请相关认证。

总之，企业在申请音视频系统集成企业资质证书时需要前往当地工业和信息化部门进行办理，同时需要了解相关政策和法规，按照要求准备相关材料并遵守相关规定。

如果企业需要行业协会或组织的认证，也可以根据自身需要进行相关申请