一专利权人发现他人侵犯自己的专利权后，可采取以下措施保护自己的权利：
1、通知侵权人停止侵权，并可要求侵权人赔偿损失。
2、请求专利管理部门处理，专利管理部门是指省、自治区、直辖市人民政府以及专利管理工作量大又有实际处理能力的设区的市人民政府设立的管理专利工作的部门。
专利管理部门有权认定侵权行为成立、责令侵权人立即停止侵权行为、就侵权引起的纠纷进行调解。
3、向人民法院申请诉前禁令，即申请人民法院作出裁定，责令被申请人立即停止有关行为。
4、向人民法院申请诉前财产保全和证据保全。
5、依法向人民法院起诉。
二、当事人可以依照《中华人民共和国民事诉讼法》向人民法院起诉。该法第六十三条规定假冒专利的，除依法承担民事责任外，由管理专利工作的部门责令改正并予公告，没收违法所得，可以并处违法所得四倍以下的罚款;没有违法所得的，可以处二十万元以下的罚款;构成犯罪的，依法追究刑事责任。《刑法》第二百一十六条规定 假冒他人专利，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。( “情节严重”为： “(一)非法经营数额在二十万元以上或者违法所得数额在十万元以上的;(二)给专利权人造成直接经济损失五十万元以上的;(三)假冒两项以上他人专利，非法经营数额在十万元以上或者违法所得数额在五万元以上的;(四)其他情节严重的情形”四种情节。)一.一般，普通的专利侵权可以采取向专利行政管理部门(当地知识产权局)举报走行政处理途径。专利行政管理部门根据侵权情节依职责可作出行政处罚决定：1.责令侵权者停止侵权;2.没收违法所得;3.罚款等。在行政处理过程中，专利行政管理部门可采取的行政手段有：1.调查收集有关侵权证据;2.查封、扣押涉嫌假冒专利产品等。“侵权证据的调查收集”和“对假冒专利产品的查封、扣押”均是日后对侵权者追诉、解决侵权赔偿问题的有力佐证。目前，国家已逐步认识到保护知识产权的重要性、紧迫性，认为自主创新是一个国家良性发展的长久之计，因此在“十二五”规划纲要中着重提出“建设创新型国家、社会”国策。从中央到地方(各部门联合)均加强了打击侵犯知识产权、打击假冒伪劣力度，一个保护知识产权的良好国家氛围正逐步构建。专利管理行政部门是国家管理专利工作的职能部门，其在打击专利侵权、保护权利领域起到首当其冲作用，对整个专利侵权事件的处理，其所发挥的作用应日益凸显。二.专利民事诉讼途径一般是解决专利赔偿、制止侵权的途径。专利权人通常在侵权证据已较充分的前提下，依据《专利法》第六十五条规定： “侵犯专利权的赔偿数额按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定;实际损失难以确定的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定。权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的，参照该专利许可使用费的倍数合理确定。赔偿数额还应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。 权利人的损失、侵权人获得的利益和专利许可使用费均难以确定的，人民法院可以根据专利权的类型、侵权行为的性质和情节等因素，确定给予一万元以上一百万元以下的赔偿”向侵权行为人要求侵权赔偿。当然，《专利法》在治理专利侵权领域同样赋予了专利权人1.申请诉前责令停止侵权行为;2.申请诉前证据保全两大侵权诉讼手段。三.专利刑事诉讼途径是对特定专利侵权行为所采取的权利保护途径。《刑法》第二百一十六条规定 假冒他人专利，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。这里的“假冒他人专利”“特定”行为表像如下：1.未经许可在产品或者产品包装上标注他人的专利号;2.明知1项产品而销售;3.在产品说明书等材料中未经许可使用他人专利号等等情节严重行为。我国《刑事诉讼法》在第七十七条规定：“被害人由于被告人的犯罪行为而遭受物质损失的，在刑事诉讼过程中，有权提起附带民事诉讼。…… 人民法院在必要的时候，可以查封或者扣押被告人的财产。”赋予专利权人在刑事案件中直接追究侵权赔偿的权利。专利侵权刑事诉讼途径发起，除专利权人直接向公安机关举报外，专利行政管理部门、人民法院等在处理专利侵权案件中如认为涉嫌犯罪，也应当向公安机关移送。相关的司法解释还赋予专利权人单独向人民法院起诉 追究“假冒专利罪”的刑事自诉权。该权利要求专利权人有证据证明侵权事实和情节条件下行使。