要将内镜清洗消毒器出口到菲律宾，您可能需要满足以下资质认证要求：

FDA（Food and Drug Administration）注册：在菲律宾销售和使用医疗器械需要获得FDA注册。您需要向菲律宾FDA提交注册申请，并提供符合要求的技术文件和证明材料。

License to Operate (LTO)：菲律宾FDA要求医疗器械出口商获得合法的经营许可证（License to Operate）。您需要向菲律宾FDA提交LTO申请，并提供相关的企业和产品资料。

ISO认证：虽然ISO认证不是菲律宾强制要求的资质认证，但是持有ISO 13485质量管理体系认证能够增加产品在菲律宾市场的竞争力和可信度。

菲律宾产品标准认证：根据菲律宾的标准和规定，您可能需要获得相关的产品标准认证，以证明您的内镜清洗消毒器符合菲律宾的要求。