酶底物法 （ enzyme substrate technique）的原理是 :利用大肠菌群细菌能产生β2半乳糖苷酶 （β2D2galactosidase）分解 ON 2PG （O rtho2 nitrophenyl2β2D2galactopyranoside ） 使培养液呈黄色 ，检测水样中是否含有大肠菌群。利用大肠埃希菌产生 β2葡萄 糖 醛 酸 酶 （ β2glucuronidase ） 分 解 MUG （ 42 methyl2umbelliferyl2β2D2glucuronide）使培养液在波长 366 nm紫外光下产生蓝色荧光 ， 检测水样中是否含有大肠埃希菌。酶底物法有商品化试剂供应 ，实验操作简便 ，无需确认试验 ，可同时检测水样中大肠菌群和大肠埃希菌。如果改变培养温度 ，还可检测耐热大肠菌群。该方法检测周期短 ， 18 ～24 h 即可报告结果。可见该方法较大的特点是节省了时间和人力。
水质pH值的检测用电位法检测水质的pH值时，是以玻璃电极作指示电极，饱和甘gong电极作参比电极，侵入待测溶液中组成原电池，采用酸度计直接测量此原电池的电动势，在酸度计上直接读出待测水质的pH值，在测量之前要先用pH标准缓冲液来校正仪器上的标度，使指针所指示的标度值恰好为标准溶液的pH值，然后在换上待检测的水质，就能测得其pH值了，不过为了尽量减少误差，大家应选用pH值与待检测水质相近的标准缓冲液，而且在检测的过程中尽量要保持温度的恒定。
水中粪大肠菌群的常见检测方法
1、聚合酶链式技术
提取粪大肠菌群混悬液和待测水样的DNA，利用PCR技术扩增编码约260bp的LacZ基因（β-半乳糖苷酶基因）和约150BP的UdiA基因（β-D-半乳糖苷酶基因）的DNA，分别检测大肠菌群数和大肠杆菌。
2、荧光原位杂交技术
由于粪大肠菌群特异的DNA序列，大肠菌群检测，借助荧光标记的特异寡聚核苷酸片段作为的探针与待测水样中的DNA分子杂交，将杂交细胞经荧光检测体系在镜下对待测DNA进行定性、定量分析，确定菌群数。
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