不同型号的二级生物安全柜的主要区别在于：排气的比例以及气体经过空气高压再循环的比例不同。另外，不同的二级生物安全柜具有不同的排气方式：有的安全柜将空气过滤后直接排到室内，有的是通过连接到专用通风管道上的套管或通过建筑物的排风系统排到建筑物外面。
二级生物安全柜的一个独有特征就是由垂直层状薄片的(无定向的)HEPA过滤器过滤后，生物安全柜品牌有哪些，再安全柜内部形成向下流动的气流。气流不断地冲能可产生空气传播的安全柜内部，从而避面存放在柜体内的样品受到。这样的气流被称作下沉气流。
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特别注意：在使用生物安全柜的过程中，应注意不要将软质、细微的物品放在工作台面上，生物安全柜哪个牌子好，以免其被台上的回风隔栅吸入负压风道和风机中，影响设备的运行。
日常要进行检查，确滤器与系统间的密封牢固无泄漏。一旦发生泄漏，应用扳手将螺丝帽适度拧紧，鉴于过滤器中可能充满了生物危害性物质，因此应由专业人员对其进行更换或维修，在更换及/或维修之前，有必要对安全柜进行消毒清洁。
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