1．深圳出口加工区有“国境内关境外”的政策，即是在国家边境内，但受到海关的特别监管。货物从国内进入深圳出口加工区等于出口，享受出口的一切政策；从国外进入深圳出口加工区保税，入区时不征收进口环节的税费。
2．深圳出口加工区具有加工、研发、检测和维修，加上拓展了保税物流功能，实际上已经是个综合保税区，在海关地位和香港一样，是对香港功能的一个有益补充。
3．国内出口的货物，通常会遇到客户拒收货物、拒付尾款、包装不合格、标签不合格、质量不合格、卡板不合格、电子产品系统升级，或者是售后服务等一些其他原因，需要把货物退回国内简单的加工和检测，通过深圳出口加工区可以有效避免在传统方式上遇到的手续。
4．从国外退运的货物退到深圳出口加工区还等于货物留在国外，无需向海关申请退运货物。优点如下：
5．1、手续简便。无须办理复杂的退运手续，无需向海关申请退运货物, 无需交纳保证金。
6．2、交通便利。在时间和成本上大大节约，特别从香港码头提货到深圳出口加工区只需3小时。维修成本是香港三分之一。
7．3、无负面影响。因地点是特殊监管区域和一般区域是隔离开的，故此在税务、工商、外汇等环节都省略了，不存在负面影响。
8．同时，我们可以配套流水线，涉及特殊的检测工具和仪器可以临时申报进区，用完即可返回工厂。