样品质检-项目确认-芯片实验-数据分析
二、样品要求
1. DNA 浓度大于50ng/ul。
2. DNA 样品体积大于20ul。
3. DNA 总量大于1ug。
4. DNA 的吸光度260/280比值在1.7-2.1之间,琼脂糖电泳检测DNA主带清晰完整,无明显RNA污染及蛋白质大分子污染。
5. 请附送一管DNA样品的溶解介质。
6. 请务必保证样品运送过程中温度保持在4度以下,夏季以干冰运送为好。
三、芯片的特点
1.密度高信息量大
BeadArray芯片密度高,9平方毫米的面积上有5万个不同类型的微珠,一张芯片*多可容纳300k特异性标记的微珠。
2.需要样本量少,成本低
illumina芯片面积小意味着需要的标记样品量少,反应所需样品量仅为250ng;全基因组分型芯片仅为750ngDNA。
3.重复性好
由于标记的微珠混合均匀,且是自行组装的,不存在点样误差,每张芯片在解码时都通过杂交进行质量控制,illumina对不同304,556个SNP进行了对照实验,结果显示304,511个SNP无差异,重复性达到了99.99%。
4.实验成功率高
BeadArray技术是利用编码序列间接杂交的。
所有的编码序列都经过特殊设计,具有近似的杂交温度,退火温度以及CG含量稳定等特点,杂交效率很高。
所以,使用微珠芯片进行基因分型实验的成功率极高。
对2,267,188个SNP进行分型,其中只有1,432个基因型未被检出,实验成功率达到了99.94%。
5.准确性好
对BeadArray芯片得到的1,940,990个SNP结果进行分析,从中只发现发了97个SNP有孟德尔遗传错误和578个基因重组错误。
其孟德尔遗传错误率只有0.0049%,基因重组率错误只有0.029%。
6.芯片格式灵活多样
客户可根据样本量以及SNP位点数量来确定使用何种格式的芯片。
治具结构类型
1.翻盖式
适用的产品类型:尺寸小的PCB板,如手机、数码相机、MP3/MP4等产品。
适用的芯片类型:封装尺寸20*20mm以下,球数在300pin内的产品。
2.夹手式
适用的产品类型:尺寸中等和外接端口较多的PCB板,如网络路邮器、数码相机、MP3/MP4等产品。
适用的芯片类型:封装尺寸30*30mm以下,球数在300pin内的产品。
3.旋压式
适用的产品类型:PCB板尺寸和芯片尺寸较大的产品,如电脑主板,游戏机,打印机等产品。
适用的芯片类型:封装尺寸30*30mm以上,球数在500pin以上的产品。
治具连接方式
1.pogo pin连接
优点:维修时主板拆换方便快捷,探针长度较短,的减少针间信号的串扰,可用作高频信号点的测试。
缺点:成本较高,针头弹力、刺穿能力较弱,针盘结构在待测的主板尺寸太大时需有定位孔、紧固螺丝孔。
2.转接针焊接型
优点:成本较低,特别适合大尺寸且没有紧固螺丝孔、定位孔的PCB板和点数较多、尺寸较大的芯片。
缺点:维修时交换主板需要专用返修工具,转接针盘循环焊接*多2-3次即要报废更新。