随着农业发展，水溶肥料作为一种新型肥料应用逐渐普及。与传统肥料相比，水溶肥料配方多样，施用方法也非常灵活。
合理掌握用量和次数
1、少量多次施用。这是施用水溶肥料为重要的原则，因为这种方法不仅符合植物根系不间断吸收养分的特点，也符合水溶肥料养分易流失的特点。少量多次施用，还可以大大提高水溶肥料的利用率。
2、注意养分平衡。水溶肥料一般采取浇施、喷施或者将其混入水中，随同灌溉（滴灌、喷灌）施用。这里需要提醒的是，采用滴灌施肥时，由于根系生长密集、量大，这时对土壤的养分供应依赖性减小，更多依赖于通过滴灌提供的养分。对养分的合理比例和浓度有更高要求。如果配方不平衡，会影响作物生长。另外，水溶肥千万不要随大水漫灌或流水灌溉等传统灌溉方法施用，水溶肥生产厂家，以避免肥料浪费和施用不均。
3、安全施用，防止叶片和根系。水溶肥施用不当，特别是随同喷灌和微喷一同施用时，极容易出现烧叶、烧根的现象。根本原因，就是肥料溶度过高。因此，在调配肥料浓度时，要严格按照说明书的浓度进行调配。但是，由于不同地区的水源盐分不同，同样的浓度在个别地区会发生叶片和根系的现象。生产中保险的办法，就是通过肥料浓度试验，找到本地区适宜的肥料浓度。
大量元素，水溶肥目前来讲还是大量元素为主，大量元素无外乎氮、磷、钾三大元素，不过这些元素与传统复合肥不同，如氮元为硝态氮NO3-N、铵态氮NH4 -N、脲态氮Urea-N，磷元素为水溶性磷P2O5，钾为可溶性钾且吸收转化效果好的磷酸二氢钾或者，三者都可全溶解于清水无杂质沉淀，这就极大的提高了养分吸收和一些滴灌施肥，目前市场上也有同养分的水剂水溶肥料以清液为主。
4)由于水溶肥特有的性质，不要与育苗基质混用且不做底肥，水溶肥批发，只做追肥用。
(5)灌溉时不要选择河水和水质较硬的井水，容易产生沉淀，影响肥效。
(6)施肥时一定要避开阴雨天，否则肥料会随水流失、渗透土壤深处，造成浪费。
(6)滴灌施肥时，要先滴清水，水溶肥，等管道充满水后再开始施肥，施肥结束后再继续滴清水20~30分钟，将管道中残留的肥液全部排出。很多农户不按正确流程施肥，堵塞滴灌头后就怀疑是水溶肥溶解性不好，有残渣。
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