前者的性质是企业，且以营利为目的；后者的性质是事业单位，或虽为某企业所设，但以研究相关的课题为目的，即不为谋利。
所以，二者无论是从性质和所为的目的皆有着根本的不同。
工商研究院办理类型
1医学中医研究院、中医医学研究院、中研究院、国际中医研究院，国际医学研究院、医学研究院、医学技术研究院
2教育教育科技研究院、教育科学研究院、教育科技院
3:工程技术工程技术研究院、信息技术研究院，
4:农业农业研究院、国际农业研究、农业研究院、农业科学研究院
5:自然科学国际自然科学研究院，自然科学研究院，生物自然科学研究院
6:其他院、艺术院、文化院、、工作室、研究所、研究中心、科技中心、科技院、艺术培训中心
办理民非研究院的审批条件
13-5个备选字号
26名理事会成员，至少2名北京
3注册资金50万，需要实质入资，不得取出
4办公地址可核查，面积要求30平以上（我方可提供）
5提供可行性研究报告
6办理周期3个月左右
研究院注册条件
办理民非研究院的审批条件
13-5个备选字号
26名理事会成员，至少2名北京
3注册资金50万，需要实质入资，不得取出
4办公地址可核查，面积要求30平以上（我方可提供）
5提供可行性研究报告
6办理周期3个月左右
注册艺术院、文化院、研究院需要什么材料
1字号（名字）确认，名称核准
2人员信息确认（法人，财务）
3注册资金，经营范围确认
4公司章程（代为办理）