商业特许经营的核心是无形资产的输出，注册商标、企业标志、专利、专有技术等经营资源构成了特许经营合同的主要标的物。北京高院《指导意见》认为经营资源也包括“字号、商业秘密、具有独特风格的整体营业形象，以及在先使用并具有一定影响的未注册商标等能够形成某种市场竞争优势的经营资源”。
无形资产输出有特殊的法律程序要求。《管理条例》第31条规定“特许经营活动中涉及商标许可、专利许可的，依照有关商标、专利的法律、行政法规的规定办理”。比如，如果涉及注册商标，依照《商标法》等有关规定，必须订立商标使用许可合同，约定许可使用类型，并应当在合同签订3个月内，报商标局办理商标使用许可合同备案。
商标使用许可合同备案与否，对被特许人行使正当权益具有重要影响。根据《高人民法院关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》，除非当事人另有约定，如果商标使用许可合同未经备案，虽然不影响该许可合同的效力，但不得对抗善意第三人。
商标许可使用类型影响被特许人商标专用权的救济权利的行使。在发生注册商标专用权被侵害时，根据上述高人民法院司法解释：（1）独占使用许可的，被特许人可以提起诉讼；（2）排他使用许可的，被许可人可以和商标注册人共同起诉，也可在商标注册人不起诉的情况下自行提起诉讼；（3）普通使用许可的，被特许人经商标注册人明确授权，可以提起诉讼。
参考资料：商业特许经营的核心是无形资产的输出，注册商标、企业标志、专利、专有技术等经营资源构成了特许经营合同的主要标的物。北京高院《指导意见》认为经营资源也包括“字号、商业秘密、具有独特风格的整体营业形象，以及在先使用并具有一定影响的未注册商标等能够形成某种市场竞争优势的经营资源”