这种方法可以被应用于的生物标记检测中，并可以广泛应用到医学诊断中各种生物标记物的定量检测，以及食品安全和环境检测中。（Y. Zhao， D. Du， Y. Lin， Glucose encapsulating liome for signal amplification for quantitative detection of biomarkers with glucometer readout， Biosensors and Bioelectronics，羧基磁性微球， 2015，沧州磁性微球， 72: 348-354.） 磁性微球如何与蛋白偶联？ 当微球带有—OH、—NH2、—COOH等功能基团时，可进行的共价或者非共价偶联，可用于结合相应的抗原或从而形成磁珠，即蛋白偶联过程，可采用EDC/HNS偶联的方法。 将100mg磁性微球分散于2mL磷酸盐缓冲液（PBS缓冲盐10mmol/L，PH7.4）中，加入50mgEDC(1-(3-二甲氨基丙基)-3-碳)，25mgNHS（N-羟基琥珀酰）和适量BSA（以此为例），室温振荡反应2h。磁分离，保留上清，磁性微球用PBS洗涤3次即可。
结合缓冲液一般采用醇类结合，比如乙醇，有些厂家缓冲液是直接使用柱法的试剂转换成磁珠法的，会发现在柱法中表现很好的试剂，在磁珠法中得率很低。这是因为柱法不但其硅胶柱具备结合核酸的能力，还有类似「分子筛」的效果。而磁珠法一般是通过静电吸附、疏水作用来结合核酸，所以对于结合液的结合能力要求会更高，一般可以通过提高醇的比例来增强结合能力，同时，也要提高离液盐（胍盐、钠盐等）的浓度来促进核酸与磁珠的结合。
磁性纳米粒子与多种高分子具有良好的生物兼容性。 磁性纳米粒子的表面修饰包括：非聚合物有机固定、聚合物有机固定、无机分子固定、靶向配套修饰等。常用来作为修饰的物质有聚乙二醇、葡聚糖、聚乙烯吡咯烷酮、脂肪酸、聚乙烯乙醇、多肽、明胶、壳聚糖、、脂质体等。磁性纳米粒子的表面修饰主要有2种途径：一是表面修饰材料与粒子表面依靠化学键结合，这通常是指一些有机小分子化合物；二是用有机或无机材料直接包裹磁性纳米粒子，主要包括表面活性剂、高分子聚合物、和二氧化硅等。表面修饰不仅增强了磁性纳米粒子的稳定性，还能提高其在水溶液中的分散性和生物相容性，提高靶向性，防止蛋白吸附，磁性高分子微球，增加其在血液循环中的时间，以及进一步复合其它的纳米粒子、化合物或生物配体，实现磁性纳米粒子的功能化。
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