一、操作不规范
小额贷款公司在坚持为农民、农业和农村经济发展服务的原则下自主选择贷款对象，小额贷款公司发放贷款应坚持“小额、分散”的原则，鼓励小额贷款公司面向农户和微型企业提供信贷服务，着力扩大客户数量和服务覆盖面，同一借款人的贷款额度不得超过小额贷款公司资本净额的5%，可以参考小额贷款公司的本地经济状况和人均GDP水平，制定高贷款额度限制度，小额贷款公司为了盈利，规避规定，超过高贷款额度限制的情况普遍存在。
二、制度不健全
小额贷款公司没有建立健全贷款管理制度，没有明确贷前调查，贷时审查和贷后核查业务流程和操作规范，没有加强内部风险控制，未按照国家有关规定建立健全企业财务会计制度，真实记录和全面反映业务活动和财务活动，未进行必要的审查，有的贷款终由小额贷款公司打入借款人个人信用卡账号，违反财务规定。
三、监督不到位
小额贷款公司实际运行过程中省金融办、当地人民银行分支机构、银监会派出机构对小额贷款公司的监管不健全，也不实，导致有的小额贷款公司非法融资，将资金没有用于三农服务，擅自变相提高利率，从事高利贷的营业。
四、人员素质低
小额贷款公司应有必要的营业场所，组织机构，具备相应专业知识和从业经验的工作人员，出资设立小额贷款公司的自然人、企业法人和其他社会组织，拟任小额贷款公司董事、监事和高ji管理人员的自然人，应无犯罪记录和不良信用记录，在实际运行过程中，是非专业人士在做决策，工作人员未经过正式培训，有的懂会计，但不懂金融，且有使用银行承兑汇票，非法贴现的目的性问题，在催要贷款的过程中，利用社会闲散人员上门催要，等同于民间高利贷，黑社会性质的催要方式。
小额贷款公司对改善金融服务，有效配置金融资源，以民间资本“输血”中小企业，促进小微企业发展有一定作用。但在实际经营中由于人员不专业、政策不规范、专业性不强等原因导致小额贷款公司或多或少存在问题和风险。所以有贷款需求，及时选择正规贷款平台。