互联网药品信息服务资格证书办理疑难点为业务发展报告，业务发展报告需要专业的人士去撰写，撰写人要根据公司的具体情况和食品药品监督管理局审批的一些要点、规则去撰写业务发展报告才可通过审批。办理互联网药品信息服务资格证书的费用是根据您公司的性质以及地区办理的难易程度而定，具体价格可以咨询。
办理流程：
（一）申请
申请人通过省食品药品监督管理局网站，点击“在线申请”进行网上申报，申请人按照要求提交申请材料。
（二）受理
收到申请材料后5个工作日以内，政务服务人员应在网上申报系统对所提交电子材料的完整性和规范性进行形式审查。
材料不齐全或不符合要求的，通过网上审批系统向申请人发出补正材料通知书（见附件）。
申报事项依法不属于本部门职权范围或申请事项不需行政许可的，不予受理，并通过网上审批系统向申请人发出不予受理通知书（见附件）并说明理由。
申请事项属于本部门职权范围，申报资料齐全、符合形式要求的，或申请人按照要求提交全部补正资料的，予以受理，向申请人发出电子《受理通知书》（见附件）。
（三）审查
审查过程中，如有需配合环节，申请人应积极配合。
（四）决定
湖北省食品药品监督管理局作出准予许可或不予许可的决定。
（五）制证发证
准予许可的，颁发行政许可证书，系统即时通知申请人，并同步在省局网站电子证书公示平台上公示企业电子许可证书，企业可自行下载打印电子证书。确需纸质证书，申请人可凭《受理通知单》和身份证到受理机关领取纸质证件。
不予许可的，网上发出电子《不予行政许可决定书》（盖上海市省食品药品监督管理局电子印章），系统即时通知企业。