新兴的微阵列芯片技术是分子生物学技术和计算机技术高度有机结合的产物，体积小、实验效能高 ， 可以节约人力、 物力和时间，微阵列芯片区别， 是对传统分子生物学研究方法和临床检测方法的重要补充 。在微阵列技术的实际应应用中 ，数据分析具有举足轻重的作用 ，微阵列芯片检查， 目前还没有对现有的各种统计学模型进行过综合评价 。这一缺陷亟待弥补 。虽然人类基因组草图已经绘制完成 ， 但整个基因组研究才刚刚开始 。此时如果没有把研究所产生的海量数据进行有效的管理 ， 将对后续研究的深入和应用造成严重的影响 。从现有资料来看， 应用微阵列芯片技术所产生的数据还没有统一的管理方案， 这些研究的结果仍然分散地保存在不同的数据 库中，这些数据库也处在探索阶段 。
原位合成法主要为光引导聚合技术，它不仅可用于寡聚核苷酸的合成，也可用于合成寡肽分子。光引导聚合技术是照相平板印刷技术（ photolithography ）与传统的核酸、多肽固相合成技术相结合的产物。半导体技术中曾使用照相平板技术法在半导体硅片上制作微型电子线路。固相合成技术是当前多肽、核酸人工合成中普遍使用的方法，微阵列芯片厂家，技术成熟且已实现自动化。二者的结合为合成高密度核酸探针及短肽阵列提供了一条快捷的途径。
1. 数据可靠分析
因为用基因芯片进行杂交分析，每次实验结果都会有些变化，因为包括靶DNA浓度、探针浓度、杂交双方的序列组成、盐浓度以及温度等许多因素影响了杂合双链的形成和稳定性。因此，微阵列芯片，需要进行重复试验以确保数据的准确。主要的方法是通过两次平行杂交反应，将每个基因在两个反应中的表达水平做成对应散点图，只要绝大多数基因的杂交结果都在45度斜线附近，就说明实验结果是可的。
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