现在国内生物安全柜大量应用在卫生、疾病预防控制、保健和食品卫生等领域和实验室级研究机构，在生物制药、环境监测、科研机构也有应用，至今生物安全柜的在用量约2万台。在初期，主要解决的还是填补空白，洁净工作台生产厂家，满足用户需求的问题，并未对生物安全柜用户使用中的安全维护引起足够的重视。作为绝大部分制造商，其工作重点在于产量和市场，并没有很好地开展现场安装检验和使用期间的维护检验;作为使用单位，由于对产品结构和防护原理知识的缺乏，没有安装验收和期间维护检查的安全防护意识，认为使用了安全柜就安全了，一劳永逸。
对产品安装检验、维护检验及周期检验技术指标不了解，自身没有确认能力，也没有委托第三方有资质检验机构测试的意识。
机构是生物安全柜使用的主体，由于缺乏安全防护制度和法规意识上的缺乏，甚至会使用无注册证的生物安全柜，超洁净工作台，更不用说对产品技术指标上的掌控，无法保障实验室的安全。中国食品药品网曾曝光，
食品药品监督管理局一举查获了两起使用无产品注册证生物安全柜案件，两家大型机构用于病检查的仪器竞无《产品注册证》，洁净工作台，经查，一家医院无法提供生物安全柜的《产品注册证》，另一家医院生物安全柜的《产品注册证》系。安丘市食品药品监督管理局依法对两家医院进行了处罚并展开进一步追查。
Ⅲ级生物安全柜用于操作危险度4级的微生物材料，无菌洁净工作台，可以提供个体防护。Ⅲ级生物安全柜的所有接口都是“密封的”，其送风经HEPA过滤，排风则经过两个HEPA过滤器，进一步提高了对环境的保护。Ⅲ级生物安全柜由一个外置的专门的排风系统来控制气流，使安全柜内部始终处于负压状态(不低于120 Pa)。只有通过连接在生物安全柜上的结实的橡胶手套，手才能伸到工作台面。Ⅲ级生物安全柜应该配备一个可以灭菌的、装有HEPA过滤排风装置的传递箱。Ⅲ级生物安全柜可以与一个双开门的高压灭菌器相连接，并用它来清除进出生物安全柜的所有物品的污染。可以将几个手套箱连在一起以增大工作面积。Ⅲ级生物安全柜适用于三级和四级生物安全水平的实验室。
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