木薯渣的易腐性和贮存问题：
未经过处理的鲜木薯渣含水量约为80%~90%，并且还含有可溶性的营养物质，这就为微生物的滋生提供有利条件，在这种情况下鲜木薯渣在1~2d内会被有害物污染变成黄色或黑色。木薯渣含粗纤维较多，导致其适口性较差。
目前，木薯渣水分，较为经济快捷的处理方法是将木薯渣先沉降后进行机械脱水，再经过干燥，直接用于生产配合饲料；随着生物技术的发展，用木薯渣发酵生产单细胞蛋白饲料，干烘木薯渣，成为现在研究和利用木薯渣饲料原料的热点。在木薯渣中接种产朊假丝酵母进行固态发酵，结果木薯渣中蛋白质、烟酸、泛酸、VB1和VB2含量分别提高250%、340%、1000%、120%、150%，在一定程度上提高木薯渣的营养成分。
木薯渣粗蛋白及无机盐含量较低，与麸皮、米糠混合或同时添加无机氮源及无机盐，可作为发酵培养基合成植酸酶，高浓度的磷抑制植酸酶的合成。
发酵条件为:木薯渣添加2 % NH4NO3，0.01 % K2HPO4，0.05 % MgSO4·7H2O，0.05 % KCl，0.01 % FeSO4·7H2O，0.9 % SDS，培养基水分含量60 %~65 %，10 g木薯渣250 mL三角瓶，接种量为2 mL菌悬液(2.8×108个孢子mL)，自然pH值，培养温度28~31 ℃，第8 d达产酶高峰，高峰期产酶量为6 730 Ug干曲.
以木薯渣作为基本原料，辅以不同比例的蔗渣，菌糠等，配制成9个配方的木薯渣复合基质，并进行理化性状分析和辣椒穴盘育苗试验。
绝大部分复合基质的容重，pH，C/N，青岛木薯渣，电导率和大小孔隙比均在优良无土栽培基质要求的范围内;其中复合基质配方2(67%木薯渣 5%蔗渣)，配方7(62%木薯渣 10%菌糠)和配方9(42%木薯渣 30%菌糠)对辣椒穴盘育苗的效果较好，所对应的辣椒苗的株高，地上部鲜重和根鲜重均比其它基质配方高，辣椒苗根部结团效果亦较好。
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