在选择将子公司还是母公司放在海南时，需要综合考虑多方面因素，包括税收优惠、隔离风险、资本运作等。
税收优惠：海南作为自由贸易港，实现全岛封关零关税之后，部分企业所得税和个税的上限均降到15%。这对于在海南注册的子公司或母公司来说，都是一种税收优惠，可以减轻企业负担，提高盈利空间。
隔离风险：如果选择在海南注册子公司，那么风险也是在母公司的风险承担范围内。而如果选择注册母公司，以母公司的注册资金为上限去承担有限责任，不会影响到自然人股东。这样可以有效隔离风险，保护个人财产安全。
资本运作：如果未来有在海外上市的计划，注册母公司会更为有利。因为这样可以省去注册离岸公司的时间和费用，方便资本运作。此外，注册母公司还可以享受到更多的资本运作机会，未来的发展空间也更大。
综上所述，对于子公司和母公司放在海南哪个更好，需要根据实际情况进行综合考虑和权衡。如果更注重税收优惠和隔离风险，可以选择注册子公司；如果更注重资本运作和未来发展空间，可以选择注册母公司。