海淀区超市、食杂店食品经营许可证和卫生许可证的办理流程如下：
填写食品经营许可证申请表并提交申请。
提交申请时，需要携带本人身份证、个体工商户营业执照或法人登记证等主体资格证明的原件或者复印件，以及从业人员的身份证复印件和健康证原件。
现场核查和绘制店铺的平面图。
提交缴纳税费单据证明，证实自己所使用的水是正规自来水公司提供的。
将以上信息提交到当地市场监督管理局，包括《食品流通许可申请书》、营业执照、负责人及食品安全管理人员的身份证明、与食品经营相适应的经营设备、工具清单、与食品经营相适应的经营设施空间布局和操作流程的文件、食品安全管理制度文本等。
经过检测符合规定后，即可依法取得食品经营许可证。
以上流程仅供参考，具体细节可能因地区和具体规定而有所不同。建议在申请前咨询当地的市场监督管理局或卫生监督部门，了解准确的信息和要求