电子结肠内窥镜的生产许可证办理需要按照相关法规和标准进行申请。具体办理流程如下：
准备申请资料：包括企业工商营业执照、申报产品为第二类医疗器械的声明、产品技术要求预评价报告、质量管理体系文件等。如果是自行生产，还需准备第二类医疗器械注册证资料和生产许可资料；如果是委托生产，只需准备第二类医疗器械注册证资料。
提交申请：将准备好的申请资料提交给省级或guojiaji药品监督管理部门。
受理：药品监督管理部门会对申请资料进行审查，符合要求的会受理。
现场检查：药品监督管理部门会对生产场所进行实地检查，评估生产环境和设施是否符合规定。
审核与批准：经过审查和评估后，药品监督管理部门会作出是否批准生产许可证的决定。
领取生产许可证：如果获得批准，就可以领取电子结肠内窥镜的生产许可证。