3、Mini-SATA（mSATA）变体
尽管共享Mini PCI Express外形，但是mSATA插槽不一定与Mini PCI Express兼容。因此，仅某些笔记本与mSATA驱动器兼容。大多数兼容系统都是基于英特尔的Sandy Bridge处理器架构，使用了Huron River平台。 2011年3月至4月发布的联想ThinkPad T，W和X系列笔记本电脑在WWAN卡槽中支持mSATA SSD卡。 ThinkPad Edge E220s / E420s以及Lenovo IdeaPad Y460 / Y560也支持mSATA。
一些笔记本电脑（特别是华硕Eee PC，苹果MacBook Air以及戴尔mini9和mini10）使用PCI Express迷你卡作为固态硬盘。该变体使用预留和几个非保留引脚来实现SATA和IDE接口直通，只保留USB，地面线，有时候还有核心PCIe×1总线保持不变。这使得“miniPCIe”闪存和固态驱动器出售上网本大部分与真正的PCI Express Mini实现不兼容。
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