LCMS检测蛋白结合并不能直接捕获相互作用的蛋白质，而是对相互作用的蛋白质进行后续鉴定，如定性定量鉴定、分子量鉴定、翻译后修饰方式鉴定以及一级结构鉴定等。
进行LCMC分析首先要获得相互作用的蛋白质，可以通过免疫沉淀（IP）、免疫共沉淀（Co-IP）、Pull Down和GST Pull Down等技术获得与目标蛋白相互作用的靶蛋白，通过洗脱等方式将靶蛋白从混合蛋白样品中分离出来进行液相色谱-联合质谱分析。其分析原理与正常蛋白质质谱分析一样，通过蛋白酶切-肽段分离富集-LCMS液质串联检测-质谱数据分析流程zuì后实现目标蛋白的鉴定。LCMS可对IP、Co-IP样品及GST融合蛋白Pull-down等纯化样本中的蛋白/蛋白混合物进行质谱分析，用于鉴定两种已知的感兴趣蛋白质可能存在的直接相互作用或寻找可能与目标蛋白存在相互作用关系的未知蛋白。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台，结合Nano-LC色谱，提供基于LC-MS的蛋白质相互作用分析服务技术包裹，可对IP、Co-IP样品及GST融合蛋白Pull-down等纯化样本中的蛋白/蛋白混合物进行质谱鉴定，验证已知的相互作用的蛋白鉴定未知的蛋白相互作用，欢迎免费咨询。
百泰派克生物科技-生物药物表征，生物质谱多组学优质服务商
北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP）从事以生物质谱为依托的生物药物表征，大分子物质（包括蛋白质、多肽、代谢物）质谱分析以及小分子物质检测服务。
公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；
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业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；
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