巴基斯坦政府规定，企业需在每月15日前上报并缴纳上一月份的销售税、联邦消费税（FED)等。进（出）口税费应在货物进（出）口之日起15天内完成上报并缴纳。企业所得税则在本年末申报并缴纳。
注册巴基斯坦公司后主要有销售税和企业所得税，销售税每月或每季度申报一次，企业所得税一年申报一次：
1、企业税率：国有企业35%（含附加费）；其他企业45%（含附加费）；金融企业50%（含附加费）。
2、代扣所得税：对合同金额在3千万卢比以下的，适用5-7%的税率；在3千万卢比以上的，适用6-8%的税率；对支付货款金额征收1-5%。
3、销售税：销售税税率是15%，190种工业用品是按20%的税率征税。
企业向当地税务机构报税时需要提交的文件包括：税务报表、企业税号文件、报税单等。另外，当地税务机构每年不定期抽查企业相关会计凭证和单据是否与上述文件相符。
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