商业特许经营者备案，是需要经营地的商务部部门办理，
在办理前，确认办理的机构要满足以下要求：
1、公司成立满一年以上，经营范围应含特许经营体系；
2、直营店（两店一年），即两子公司或两分公司或法人名下的两个个体工商户，且都需经营满一年以上，如果是收购过来的，则从变更日起算；
3、如果主营业务是大型酒店管理，网上购物或远程教育这类新兴企业，可忽略上面的两店一年要求。
需要提供的材料：
1、办理机构营业执照
2、被特许人证明
3、经营资源的许可证明
4、特许合同
5、特许操作手册
办理周期需要30个工作日，公示期为30天。
怎样办理商业特许经营备案
申请要求：
1、需要少两个店（营业执照满一年以上)
2、公司要有商标（满一年以上）
3、分公司要满一年以上、子公司成立满一年以上，特许人要持股在51%以上。经营范围都要有特许经营体系
4、特许人关联的公司占股51%以上，占股一年以上
办理周期：1-3个月
下面是“两店一年”的具体解析：
“两店一年”从字面的意思就是公司名下有两家直营店，且直营店都经营一年以上。如果公司名下没有两家直营店，公司名下有两家分公司、子公司，或者法人名下有个体工商户也行。但是时间要满足一年以上。
第二，公司名下有商标，且商标的类别和公司经营项目相关。
第三，办理商业特许经营备案，提供相关的前置条件证明。例如餐饮加盟行业，公司的直营店拥有食品经营许可证。
商业特许经营备案是加盟行业的证书之一。按照相关条例规定，企业跟加盟商签订份合同的15工作日内办理商业特许经营备案。如果没办理，被加盟商或者竞争对手举报，公司会被罚款2万元，情节严重会被公示。如果您这边是从事加盟行业，一定要办理商业特许经营备案。
不同特许人可否使用同一商标进行备案？
同一特许经营资源（如同一商标），仅可进行一次特许经营备案，但对于已备案过的特许人，后续再就其他经营资源进行备案则无限制。也就是说，公司可利用不同的商标申请多个特许经营备案，但是对同一商标，仅可进行一次备案。
可否通过门店使公司取得“两店一年”的？
目前通过门店，无法使得公司快速取得“两店一年”。实践操作中，如门店对应公司涉及持股人股权，则需自完成之日起1年后方可办理“两店一年”的认定。
05关联公司的直营店能否认定为特许人的直营店？
可以。所述“关联公司”仅指特许人的母公司、全资或控股的子公司；且关联公司的直营店应从事与特许人系同一品牌、同一性质的业务。特许人以其关联公司的直营店作为自己直营店的，应提交以下文件：
（1）关联企业之间的资产关系证明（关联企业之一应为特许人）；
（2）关联关系发生时间满一年以上的证明（如收购他人店铺时，其经营时间应从收购之日起算）。
商业特许经营备案是指企业之间通过签订特许经营合同，授予特许人将商业标志、营业模式、技术秘密等权利在一定期限内许可给受许人使用，并收取相应费用的法律行为。此过程需按照国家法律法规的规定进行备案，以保护双方的合法权益。完成备案的企业可享受政府的优惠政策，提高企业知名度，拓展市场份额。
问题：备案费用支付后出现问题怎么处理？解答：如果备案费用支付出现问题，可以与主管部门联系沟通，了解具体原因并及时处理，以确保备案流程不受阻碍。
问题：备案申请费用包括哪些部分？解答：备案申请费用一般包括备案申请费、审查费、公告费等，具体费用标准会根据地区和主管部门的规定而有所不同。
备案费用是备案过程中需要慎重考虑的因素之一。深入分析商业特许加盟备案的费用构成，提供费用预算和优化建议，包括加盟费、管理费、广告费等费用的计算方式和支付方式。通过合理的预算和费用优化策略，可有效降低备案成本，帮助您控制费用支出。