1、申请：申请单位提出申请，填好《卫生许可证申请书》并提交符合国家标准的相关材料。
2、备案：按照卫生许可证审理标准及公共场合许可证的标准，相关部门对属于审理区域范围申请材料进行确认、备案。假如是公共场合，申请单位先要申请办理工程项目环境卫生核查评定，等工程验收成功后，在申报申请办理《公共场所卫生许可证》。
3、审理：通过审核后，卫生部门在5个工作日内凡符合审理所规定的单位发放《行政许可受理通知书》；对不符合审理要求发放《行政许可不予受理决定书》；针对材料不全，传出《行政许可补正材料通知书》。
4、核查：卫生部门立案后，机构业务员依照国标对申请材料进行核查，对有问题的提出改进措施。
5、确定：自审理申请办理之日起二十日内，卫生部门依据审核意见，对符合标准企业准许行政许可事项。
6、送到：卫生部门需在十个工作中日内向型做出准许行政许可决定的单位或个人方法《卫生许可证》。
自然，在申请卫生许可的过程当中，卫生部门有权利根据自己的需求规定申请单位填补别的相关信息。
二、所需要的有效证件如下所示：
1、申请书
2、《卫生局卫生许可证申请书》
3、名称预先核准通知单影印件
4、卫生制度机构（架构设计）名册
5、各种场地卫生制度
6、主要生产设备明细
7、工程项目四置图、平面布局图(空调机组生产线、生产线设备、给排水系统、卫生设备合理布局、自然通风排气管)，需要提供宏伟蓝图或电脑打印图(标出规格、总面积与经营公司名称)。
8、从业者办理健康证和卫生保健知识培训证