指排污单位向生态环境保护行政管理部门提交申请后,生态环境保护行政管理部门经核查发放容许排污单位排出一定数量污染物凭据。排污许可证归属于生态环境保护许可证书中不可或缺的一部分，并且普遍使用。排污许可证规章制度,就是指相关排污许可证申请、审批、授予、中断、注销、监管和罚则等多个方面要求总称。
1、根据不一样：大城市排水许可证根据《城市排水许可管理办法》；排污许可证根据《排污许可证管理方法暂行条例》，广东省这里是根据《广东排污许可证管理条例》
2、派发范畴不一样：大城市排水许可证派发目标是为城市排水系统魏武以及附设排放污水的排水户；排污许可证正常情况下包含全部向自然环境立即排出或间接性排放污水和有机废气污染物发生点排污单位。
3、排出要求不一样：仅针对大城市纳管排水户而言，大城市排水许可证并对水流量、接入水体进行了要求；排污许可证还加入了污染物质总量控制的需求。
4、颁证企业不一样：大城市排水许可证由城建部门承担派发；排污许可证由环保局承担派发，
她们的联系是：                                                            
1、大城市纳管排水户应与此同时领取排污许可证和排水许可证。
2、大城市纳管排水户排放污水务必同时符合排污许可证和排水许可证的需求，即二种许可证书中更加严格要求。