甲型流感病毒抗原检测试剂盒作为三类医疗器械，要办理生产许可证一般需要遵循以下流程：

准备申请资料：

收集与产品生产相关的技术资料、质量管理文件、生产工艺等资料，确保文件详细描述产品的性能、质量标准、安全性等。

选择注册代理机构：

选择并委托合适的注册代理机构或服务机构协助申请。他们会指导您准备申请文件，确保申请符合规定。

申请提交：

通过注册代理机构，将准备好的申请文件提交给当地的药品监管部门或医疗器械监管机构进行审批。

现场审核：

可能需要进行生产现场的审核，监管机构会检查生产制造地点是否符合相关规定和标准。

技术评审：

监管机构会对提交的申请文件进行技术评审，验证产品生产工艺的合规性、安全性和质量。

审批和许可证颁发：

审批通过后，监管机构会颁发医疗器械三类生产许可证，允许产品在该地区合法生产。

请注意，不同国家或地区的医疗器械生产许可证申请流程和具体要求可能会有所不同。在中国，生产许可证的申请与批准由国家药品监督管理局（NMPA）负责。

因此，如果您想在特定地区申请甲型流感病毒抗原检测试剂盒的三类医疗器械生产许可证，请与当地的机构或代理商联系，了解具体的流程和要求，以确保您的产品生产合法。