办理冠状动脉功能测量系统三类医疗器械经营许可证通常需要遵循一系列要求和流程：

1. 企业资质要求：

企业资质： 申请者需为合法注册的企业，具备合法营业执照等相关证明文件。

经营场所： 应有符合要求的经营场所，包括符合卫生标准的仓储、销售场所等。

2. 产品资质和技术文件：

产品资质： 冠状动脉功能测量系统应该获得医疗器械注册证。

技术文件： 提供完整的技术文件和相关证明文件，确保产品符合技术标准和法规要求。

3. 质量管理要求：

质量管理体系： 企业需建立完善的质量管理体系，确保产品生产过程符合标准和规定。

售后服务： 需提供完善的售后服务体系，包括产品质量追踪、投诉处理等。

4. 监管要求：

合规监管： 企业需要遵守国家医疗器械管理相关法规和政策要求，包括质量监管、信息报送等。

5. 申请递交和审查：

申请材料： 提交完整的申请文件至国家药监局或相关部门。

审查流程： 经过相关部门的初步审查和技术评估。

6. 许可审批和颁发：

审批结果： 如申请符合要求，国家药监局将审批通过，并颁发经营许可证。

7. 后续监管：

定期审核： 企业需接受监管部门的定期审核，确保持续符合经营要求。

定期报告： 定期向监管部门报告产品销售、质量监管等相关信息。

这些要求可能会因地区和国家的不同而有所差异。在申请和办理过程中，严格遵守相关法规和要求，确保申请文件的完整性和合规性是非常重要的。详细了解当地医疗器械经营许可证的具体要求和流程是至关重要的。