医疗器械生产许可证变更流程包括以下几个步骤：

1. 准备申请材料，包括变更申请表、原许可证、变更原因说明等文件。

2. 提交申请材料。申请人可以通过国家药品监督管理局网站在线提交申请，也可以到当地药品监督管理局窗口递交纸质申请材料。

3. 受理申请。药品监督管理局会对申请材料进行审核，如果材料齐全、符合要求，就会受理申请。

4. 审核。药品监督管理局会对申请进行审查，包括现场检查、技术评估、文件审查等环节。

5. 决定。根据审核结果，药品监督管理局会做出决定，同意或者不同意变更申请。

6. 颁发新许可证。如果变更申请获得批准，药品监督管理局会颁发新的许可证。

需要注意的是，申请人应当根据实际情况选择合适的变更类型，并按照相关规定提交申请材料。另外，在申请过程中，还需要积极配合药品监督管理局的审核工作，及时提供必要的信息和材料。