根据不同种类蔬菜的生育特性、需肥规律、土壤供肥状况以及肥料的种类与养分含量，科学地计算施肥量。应大力推广大棚蔬菜配方施肥技术和测土施肥技术。采用科学的施肥方法，坚持基肥与追肥相结合。基肥要以腐熟有机肥为主，配合施用磷、钾肥；追肥要根据蔬菜不同生育阶段及对肥料的需要量大小分次追肥，注重在产品器官形成的盛期如根茎、块茎膨大期、结球期、开花结果期重施追肥。基肥要深施、分层施或沟施。追肥要结合浇水进行。推广叶面施肥技术。
科学选肥
严格控制化肥的用量尤其要减少氮素化肥的用量。杜绝盲目施肥、偏施氮肥的情况。选用肥料既要考虑养分含量，又要选用杂质尤其是重金属及有毒物质含量少、纯度高的肥料，还要根据土壤情况尽可能选用不致使土壤酸化的肥料。注意微量元素肥料的使用，推广氮、磷、钾复合肥和有机、无机复合肥。
有机肥料不仅养分全，肥效持久、平稳，缓冲性大，而且富含有机质，可以改良土壤结构，对大棚蔬菜土壤环境的污染小。要大力提倡使用有机肥，要多用充分腐熟经过堆积发酵等处理的优质畜禽粪等厩肥。应用因地制宜推广秸秆还田技术、大棚蔬菜种植绿肥技术，既增加肥源又改良土壤。