对照以前的车牌办理惯例，莲塘口岸两地车牌代办也分为两种情况进行申请。第一种是以香港商户为申请对象，这一类的企业申请前提是对内地有所投资，无论是独资、合资还是三来一补等形式不限，在广东非山区投资资金超过100万美元，上一年缴纳超过30万人民币的商户，可以申请1辆以上的莲塘口岸车牌办理。
内地企业办理的要求相对而言会偏高，需要在三个指标上超出5千万方可申请。一般以企业名义申请的跨境车，需要挂靠在公司名下，有180次的通关次数。不少人对莲塘口岸两地车牌代办是否有跨省的限制表示有疑问，按照政策来看，是不受限制的，只是需要注意跨省的车险保护范围的问题。
粤港两地车牌根据规定是允许采取委托的方式进行申请，莲塘口岸两地车牌代办也不例外可以采用这种方式，主要是考虑到企业对相关申请程序比较陌生。而企业则需要准备申请书、营业执照、机动车登记证书、驾驶人信息及驾驶证、外商投资需要另外出示投资批准证书等文件。
如果按照往常的申请方法执行的话，莲塘口岸两地车牌代办会按照受理顺序进行指标轮候制来进行，但是因为莲塘口岸车牌的相关政策并未出台，具体的指标数量并没有确定，因此在申请制度上会否有进一步的调整还不得而知。
莲塘口岸两地车牌代办对于企业而言，能够避开长期以来存在的客运拥堵的问题。往返于两地洽谈业务，更主动的把握在业务洽谈上的主动性。莲塘口岸开通后，将接驳深惠高速公路、深汕高速公路等多条高速公路，深港交流将进入全方位阶段