建筑工程预算款的审核办法有很多，在这里重点介绍三种审核办法：
重点审核法 工程预算款有很多的分部工程预算款组成，每一个分部工程款又由人工，材料，施工机械施工费，规费，税金，利润等组成。由于组成要素较多，在进行工程预算款的审核时，如果对每一个分部分项工程预算款进行详细的审核，不仅浪费时间还会增加工程审核费，造成不必要的损失。因此，在进行工程预算款审核时，应该以施工重难点部位作为预算款审核的重点，对经济价值较大的部位进行全面细致的检查。同时，为了缩短预算款的审核时间，对其他经济价值相对较少的部位可以忽略不查，全面提高审核效率。
对比审核法 分析对比审核法就是通过对比具有可比性的项目，对其用途，功能，结构等进行全面细致的分析比较，确定其在建设过程中各种资源的需求量，明确竣工结算结果与工程预算款之间的差异，找出建设项目个分部分项工程的工程造价规律。建筑施工过程中常见的指标有：不同单位内的造价，建筑项目基础，电气照明，门窗及屋面的比例等。
综合审核法 所谓综合审核法就是将整个工程项目看作为审核对象，对项目建设过程中各阶段的经费进行全面细致的检查，使得个项目经费的计算方式和工程预算款的编制在一定程度上保持一致。同上面两种审核方法相比，综合审核法使用与工程量较小，工程建设规模适中的建设项目，且这种审核方法的精度较高，误差较小。
建筑工程竣工结算
工程竣工验收报告完成后，承包人应立即在规定的时间内向发包人递交工程竣工结算报告的完成的结算资料。一般情况下，工程竣工结算款的编制内容应该包括工程预算定额，取费标准，工程量清单，价格调整资料，以及工程变更依据和其他办理工程竣工所必需的文件。在尽心竣工工程量审核时，由于其审核难度较大，在进行工程量审核时需要注意，审核工程量需要严格遵守当地定额和工程量清单计价规范，同时需要注意对工程量重复的重点审核。对材料价格的审核需要注意的是建筑市场的材料多种多样且变化较大，规格，质量等都存在较大差异，使得工程竣工结算的审核存在很大的难度。因此，对不同建设周期和不同建设标准的工程的竣工结算材料价款的审核需要采取不同的审核办法，一般而言，对于工程建设周期较长的项目，要根据合同对开工，竣工时间的确定，对其进行分段材料价格调整，对于其他的工程，可经双方协商之后确定材料价格。
对工程结算款进行有效控制的方法
对工程结算款的有效控制应该包括从项目决策到项目建设完成的全过程进行有效的控制，具体可以表现为以下几个几种控制方法：
工程招投标阶段利用有效的招投标竞争方式，成为了近几年来控制工程结算款的重要方法。通过项目招投标，可以选择责任心强，技术水平高，施工技术水平，管理效率高的施工单位，这样就可以为建筑工程的造价控制提供前提保证。
采取切实有效的管理方法现阶段，对工程项目的管理采用的多的管理方法就是全寿命管理，通过全寿命管理，对项目从决策到工程施工到工程竣工使用的整个过程进行切实有效的管理，尤其是对工程决算阶段的工程造价进行重点控制，在保证控制结果准确性的同时选择优的工程施工方案，以此控制竣工阶段的工程结算。另外还要控制设计阶段的工程造价，设计人员应该选择优的工艺，技术，采取有效的措施提高工作人员的工作热情，有效控制工程及结算结果。